Строительство судов идет полным ходом, но требуются материалы. В 1715 году Скляев обследует корабельные леса, а по возвращении начинает строительство 83-пушечного «Фридемакера». Его умение помогает во многих случаях—так, в 1719 году он руководит подъемом затонувшего на котлинском рейде корабля «Лесное». В 1723 году он получает звание капитан-командора.
Федосей Моисеевич Скляев был одним из создателей русского военного флота. Под руководством Петра I и самостоятельно им построено более 10 крупных судов, в том числе 100-пушечный «Петр I и II» — но последнему проекту Петра; свыше 200 галер, скампавей и других малых судов. Ближайший сподвижник Петра I, он пережил его только на три года и умер 10 мая 1728 года. Гроб с его телом был доставлен на военном корабле по Неве в Александро-Невской монастырь и с воинскими почестями погребен.
Дом Скляева после его смерти отошел в казну. В том же 1728 году архитектор Д. Трезшш вел работы в новом Зимнем дворце и «подле того Зимнему дому в построенных от улицы бывшего двора Скляева в каменных палатах длиною на девяти саженях, поперек на семи саженях и 5 футах вышиною в два апартамента». По-видимому, как и другие приближенные царя, в 1720-х годах Скляев вместо деревянного построил каменный дом; перед ним на Неве была оборудована пристань или «гавань», которая в петровском указе от 23 июня 1719 года приводится как образец для других.